Соединения, содержащие атом фосфора, играют важную роль в биохимических процессах, входят в состав лекарственных препаратов, пестицидов и других важных для человека химикатов. Мощным методом анализа для них является спектроскопия ядерного магнитного резонанса (ЯМР) на ядрах 31P. Теоретическое моделирование соответствующих спектров имеет немалое значение для аналитического определения производных фосфора.

В 2021 году сотрудниками Института Фаворского была открыта уникальная реакция сборки 1-ацетил-1,3-бис(ариламинов) из трех молекул ацетилена, двух молекул орто-замещенного анилина и воды. 

Сотрудниками Института Фаворского совместно с коллегами из Сибирского института физиологии и биохимии растений разработано новое семество производных изоксазола, проявляющих антимикробную активность.
Синтезированные соединения показали перспективное сочетание бактериостатического эффекта (подавление роста микроорганизмов) и низкой токсичности.

В последние годы сотрудниками Лаборатории непредельных гетероатомных соединений был разработан ряд методов получения разнообразных полезных гетероциклических соединений с использованием активации производных ацетилена в суперосновных условиях.

В своей новой работе, профессор Б.А. Шаинян обсуждает связь фундаментальных понятий органической химии, ароматичности и хиральности, с размерностью пространства.
В 2019 году был опубликован обзор к.х.н. Надежды Викторовны Вчисло, посвященный использованию α,β-ненасыщенных альдегидов в синтезе азот-содержащих гетероциклов. Эта работа в журнале Asian Journal of Organic Chemistry привлекла внимание международного сообщества и хорошо цитируется:

Ярким представителем научной школы академика Фаворского был академик Иван Николаевич Назаров (1906—1957). Открытая им реакция образования циклопентенонов из дивинилкетонов под действием кислот вошла в арсенал химиков-синтетиков под именем "реакция Назарова". Этот метод выдержал испытание временем - статьи по "Nazarov cyclization" регулярно встречаются в самых престижных научных журналах.

В лаборатории непредельных гетероатомных соединений (группа д.х.н. П.А. Волкова) разработан метод синтеза представителей ряда дигидро-3H-пиррол-3-она, фрагмент которого входит в структуру различных биологически активных соединений, включая использующиеся в настоящее время лекарственные препараты.